نهج آلي للتنبؤ بنتائج السرطان بشكل أفضل
يُظهر فريق أن التنبؤ بنتائج السرطان يمكن تحسينه من خلال كسر صوامع البيانات التقليدية للمستشفيات وتحليل المعلومات، بما في ذلك الملاحظات السريرية للأطباء، بمساعدة الذكاء الاصطناعي (AI).
قام بهذا البحث فريق بحثي من مركز ميموريال سلون كيترينج للسرطان (MSK).
نهج آلي
وحسب موقع ميديكال إكسبريس، تصف دراسة جديدة نهجًا آليًا في الوقت الفعلي تم تطويره في مركز ميموريال سلون كيترينج للسرطان يجمع بين ملاحظات الأطباء النصية المجانية وبيانات العلاج السريري والنتائج وبيانات السكان الديموغرافية للمرضى وبيانات جينوم الورم من منصة MSK-IMPACT لتحديد المؤشرات الحيوية التي يمكنها التنبؤ بالنتائج والاستجابات المحتملة للعلاج.
يُطلق على هذا الجهد اسم MSK-CHORD (مجموعة بيانات الأورام السريرية المتجانسة في العالم الحقيقي)، وهو الأكبر من نوعه، حيث يجمع بيانات ما يقرب من 25000 مريض مصاب بسرطان الرئة ذي الخلايا غير الصغيرة والثدي والقولون والمستقيم والبروستات والبنكرياس.
أُجريت الدراسة بقيادة المؤلفين المشاركين جاستن جي، دكتور في الطب، وكريستوفر فونج، دكتور في الفلسفة، وكارل بيتشوتا، دكتور في الفلسفة، وثينه نجوك تران، دكتور في الفلسفة، وأنيشا لوثرا، وأشرف عليها المؤلف الرئيسي نيكولاس شولتز، دكتور في الفلسفة، ومدير مبادرة علوم بيانات السرطان في ميموريال سلون كيترينج، ونُشرت في مجلة Nature.
وجد الفريق أن التنبؤات بنتائج السرطان بناءً على بيانات MSK-CHORD تفوقت على تلك القائمة على البيانات الجينومية أو مرحلة السرطان وحدها.
من خلال تحليل أكثر من 700000 تقرير أشعة، تمكن MSK-CHORD من الكشف عن عوامل تنبؤ بالنقائل إلى مواقع أعضاء محددة. بالإضافة إلى ذلك، قاد حجم MSK-CHORD والتعليقات التوضيحية الغنية الفريق إلى تحديد الطفرات في جين SETD2 كعلامة بيولوجية غير شائعة ولكنها واعدة لاستجابة العلاج المناعي في سرطان الغدة الرئوية - وهو الاكتشاف الذي تم تأكيده في مجموعات بيانات مستقلة متعددة.
يقول الدكتور جي، أخصائي أورام الصدر في مركز ميموريال سلون كيترينج للسرطان: "تسلط نتائجنا الضوء على قوة معالجة اللغة الطبيعية وتأثير جمع عدد كبير من تدفقات البيانات للتنبؤ بشكل أفضل بنتائج المرضى".
ويضيف الدكتور شولتز: "نأمل أن يساهم مشروع MSK-CHORD في تعزيز المزيد من الأبحاث في العلاقات بين البيانات الجينومية والنتائج الواقعية في السرطان".
وقد اجتمع العشرات من الأطباء والباحثين من مختلف أنحاء ميموريال سلون كيترينج لمشاركة الخبرات، وتطوير نماذج معالجة اللغة الطبيعية، ونماذج مخاطر الذكاء الاصطناعي، والبنية الأساسية الهندسية المطلوبة لدعم الجهود.